1、是可以约定申请支付令的。签订合同时，当事人可以在合同中约定解决争议的方式，所以签订借款合同时，当事人可以约定申请支付令解决债务纠纷。2、根据《中华人民共和国民法典》第四百七十条【合同主要条款与示范文本】合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：(一)当事人的姓名或者名称和住所;(二)标的;(三)数量;(四)质量;(五)价款或者报酬;(六)履行期限、地点和方式;(七)违约责任;(八)解决争议的方法。当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。第五百零七条【争议解决条款效力】合同不生效、无效、被撤销或者终止的，不影响合同中有关解决争议方法的条款的效力。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第四百七十条
《中华人民共和国民法典》第五百零七条